PyMol软件

PyMol软件是一款由使用者赞助的分子三维结构显示软件，专门为需要的用户朋友带来非常方便的行业3d模型制作软件，不仅具有丰富的功能更有各种小工具带来极大的方便，它是是第一个拥有高速光线追踪器的全功能分子图像程序，便捷的操作方式加上适合于各种不同的操作系统更有强大的兼容里更新以及全面的绘图等你来加入，软件功能多多上手容易值得一试。

PyMol介绍

PyMOL是一款相当优秀的三维分子模型软件，软件能够用户提供全面的分子可视化系统。使用其集成的光线跟踪图形技术，它可以渲染具有更平滑的表面边界，增强的阴影和反射效果的3D分子结构。软件支持多种图像格式，包括PDB，SDF和电子密度图。

PyMol安装教程

Window系统的pymol运行需要依赖python环境，PMW模块。

而Pymol的安装是通过一个python包（Python Wheels）安装的，因此在开始之前，我们需要根据系统的位数（32位还是64位）以及python的版本来选择pymol包进行下载。

比方说，系统是windows 64位，系统中有python 3.7（或者打算安装python 3.7），那么我们就可以有2个选择，可以选择下载pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl或者pymol-2.4.0a0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，对应的版本分别是pymol 2.3和pymol 2.4.

如果有更新的pymol包

好了，背景已经介绍完了，现在进入实操。

使用方法

1、点一下菜单栏里边的便捷标志，就可以进到手机软件的主界面；
2、进到手机软件的主界面，能够对必须应用的功能开展迅速的挑选；
3、对莱单功能开展迅速的显示，让你能迅速的搜索到您必须的应用到的功能；
4、支持应用键盘快捷键来进行相关的黏贴、裁切、拷贝等功能；
5、根据蛋白质编码序列的实际操作；
6、对原子对开展相关的比照实际操作；
7、对各种各样您必须的间距、视角等进行测算；
8、对二尾結果的图型开展迅速的显示；
9、能够对相关的立体式实际效果开展迅速的显示查询；
10、对光源开展迅速的跟踪；
11、对静电感应结构力学开展迅速的检测；
12、支持对电脑鼠标的相关操作过程开展迅速的查询阅读文章；
13、能够对相关的功能开展迅速的设定，而且对信息内容的显示；
14、支持对图形的曲线图相关信息内容显示；
15、图型的显示是非常的形象化；
16、全方位的程序包的3D渲染和动漫的3d构造；
17、一个置入软件3d图象和动漫ppt演试；

PyMol特点

1、提供了强大实用的绘图工具

2、PyMOL支持多种图像格式，包括PDB、SDF

3、生成的PyMOL结构可以导出到VRML

4、PyMOL可以使用各种图像表示方法显示分子数据

5、具有可定制的颜色，结构标签，可调对象透明度，输出和控制大小，自动缩放，文本覆盖和可定制的鼠标控件

PyMol优势

拥有相当统一的用户现代化操作窗口

而且该软件的接口可以对TCL、TK的平台上使用

并且对原来的接口进行取代

分布的方式比较的直观，让用户可以清晰的查看到您需要的内容

兼容性比较的强，对各种第三方的插件支持

自定义完成对脚本的支持

可以对可是执行的文件进行快速的开放

安装python环境

1.0     如果系统中已经有了python环境，则跳过这一步。可以通过命令行：python –V来查看python的版本号。

1.1     进入python官网下载windows版的安装包

1.2     注意的是下载的安装包要和windows系统位数对应，x86对应的是32位系统；x86-64对应的是64位系统，我们就以python 3.7为例，由于我们的系统是64位的，所以下载的安装包为：Windows x86-64 executable installer

1.3     下载完成后，双击进行安装，记得勾选上Add Python to environment variables，不然后续命令行操作会出现问题。

1.4     如果安装成功，Win+R，cmd进入命令行，键入python –V就可以看到python的版本号，同时也说明安装成功。如果报错“python不是内部或外部命令，也不是可运行的程序或批处理文件。”那么说明python的地址没有加入环境变量。

2. 安装PMW

命令行键入：python -m pip install pmw

提示说成功安装pmw，Successfully installed pmw-2.0.1

3. 下载并安装pymol包

3.1 根据系统位数和python版本选择某个pymol包进行下载，放在某个磁盘根目录。在这里，我们选择安装pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，并放在D:/根目录。

3.2 命令行下，将盘符切换到D:盘，键入命令：python -m pip  install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl

提示安装成功

4.完成，找到pymol主程序的位置

 本文中pymol的主程序地址为：C:\Users\Python37\Scripts\pymol.exe

其中红色背景部分应该会与不同电脑设置及python版本相一致。

最终pymol打开的效果图：

以上便是WinWin7给大家分享的PyMol软件！